这时，又出现了干旱，谷子颗粒无收，神农又开始教导人民打井汲水，对农作物进行灌溉，这就是最早的灌溉技术。
这时，又有人民误食有毒的毒草而死亡，族中更有多数人患有疾病，神农又开始急了。
神农为此决心尝遍百草，从部落开始走起，跋山涉水，历尽了千难万险，经过了数十载，每遇到一种植物必亲自食之……
一次，神农氏在深山老林采药，被一群毒蛇围住。毒蛇一起向神农氏扑去，有的缠腰，有的缠腿，有的缠脖子，想致神农氏于死地。神农氏寡不敌众，终被咬伤倒地，血流不止，浑身肿。他忍痛高喊：“西王母，快来救我。”王母娘娘闻听呼声后，立即派青鸟衔着她的一颗救命解毒仙丹在天空中盘旋窥瞰，终于在一片森林里找到了神农氏。毒蛇见到了王母的使者青鸟，都吓得纷纷逃散。
青鸟将仙丹喂到神农氏口里，神农氏逐渐从昏迷中清醒。青鸟完成使命后翩然腾云驾雾回归。神农氏感激涕零，高声向青鸟道谢，哪知，一张口，仙丹落地，立刻生根芽长出一棵青草，草顶上长出一颗红珠。神农氏仔细一看，与仙丹完全一样，放入口中一尝，身上的余痛全消，便高兴地自言自语：“有治毒蛇咬伤的药方了！”于是，给这味草药取名“头顶一颗珠”。
神农氏尝百草时，随身带着一只能看到五脏六腑、十二经络、帮助他识别药性的活“仪器”———獐鼠，又名“獐狮”。民间有“药不过獐鼠不灵”之说。一天，獐鼠吃了巴豆，腹泻不止。神农氏把它放在一棵青叶树下休息，过了一夜，獐鼠奇迹般地康复了，原来是獐鼠吸吮了青树上滴落的露水解了毒。神农氏摘下青树的青叶放进嘴里品尝，顿感神志清爽、甘润止渴。神农氏教人们种了这种青树，它就是现在的茶树。
因为神农在尝百草的过程中经常误食毒草，随从就劝他回去，而他却说：“不能回，不能回，人们还在为分不清药草和毒草，而担忧中”
神农的女儿更是因为思念爸爸出外寻找而身亡，化为一种叫精卫的鸟儿，每日吊起石块投向大海。
神农初闻噩耗更是伤心欲绝，可又想道族中还有那么多等待他去治疗的人，顿时又继续开始食草，终于著称了一本旷世杰作，神农百草经。
神农把百草经的内容传授下去，族中生病的人渐渐的好了起来，而神农的脸上也尽是欣慰之意，